المؤشرات هي "الإشارات" التي تمكن من قياس التقدم أو الأهداف وبالتالي التغيير، على سبيل المثال التغييرات في تواتر التخلص الآمن من إفرازات الأطفال أو غسل اليدين قبل تناول الطعام. هناك مستويات مختلفة من تدخل البرنامج (مع المؤشرات المقابلة) التي تقدم الهدف العام للاستجابة معًا. الهدف هو هدف شامل معقد يتعلق عادةً بحماية الصحة العامة في المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية. تساهم الأنشطة، مثل بناء المراحيض أو مرافق غسل اليدين، في المخرجات، على سبيل المثال الأشخاص الذين يستخدمون هذه المرافق والتي بدورها تساهم في النتائج، مثل الحد من مخاطر الأمراض. يتم قياس كل مستوى بمؤشراته الخاصة.

تتعلق مؤشرات "المخرجات" الخمسة الأساسية لمراقبة الصحة (كجزء من استجابة المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية) بما يلي: 1) التخلص الآمن من الفضلات و2) غسل اليدين بالصابون في الأوقات الرئيسية و3) استخدام مياه الشرب الآمنة و4) ممارسة هذه السلوكيات الصحية المستهدفة بين جميع قطاعات المجتمع (بما في ذلك الفئات الضعيفة) و5) تمكين النساء من التعامل مع الدورة الشهرية بخصوصية وكرامة. ومع ذلك، سيعتمد اختيار المؤشرات على المساق وما إذا كان البرنامج يستجيب للمخاطر الصحية للمياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية أو تفشي مرض معين.

يحدد التقييم والتحليل الأوليان (الفصل  A ) الاحتياجات وكذلك ماذا وكيف يمكن تحقيق التغيير. تُفيد نتائج التقييم في تصميم الأهداف والمؤشرات لتدخل المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية. قد تساعد هذه المعلومات الأولية في إنشاء خط أساس لكل مؤشر بحيث يمكن للرصد تتبع أي تغييرات بنهاية ("الخط النهائي") للتدخل. قد تكون هناك حاجة إلى معلومات إضافية محددة لملء الفراغات في خط الأساس أو لفهم محددات سلوكيات معينة بطريقة أفضل. في حالة الطوارئ، قد تكون هناك تغييرات مستمرة في المساق والرصد ضرورية لقياس التقدم وملائمة البرنامج.

المراقبة تتعلق بتحديد الأشياء التي تسير على ما يرام والأشياء التي تحتاج إلى تغيير. كما يجب أن يتتبع الاستخدام الفعال والعملي للأموال وما إذا كان البرنامج يحقق التأثير المقصود. ومع ذلك، من الصعب عزو التأثير على الصحة إلى تدخلات المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية وحدها، حيث تتأثر الصحة العامة بالاستجابة ككل وليس بتدخل قطاع واحد. غالبًا ما تُستخدم المؤشرات البديلة (قياس التغيير بشكل غير مباشر، باستخدام مؤشر بديل) لدعم المراقبة، على سبيل المثال، من المعروف أن غسل اليدين بالصابون يقلل من أمراض الإسهال وبالتالي يمكن الافتراض أنه إذا كان السكان يغسلون أيديهم في أوقات محددة، فسيكون هناك تأثير على صحتهم - لذا فإن غسل اليدين بالصابون يعتبر مؤشرًا بديلاً للتأثير على الصحة.

يمكن استخدام طرق وأدوات مختلفة لجمع بيانات المراقبة؛ كانت مماثلة لتلك المستخدمة في التقييمات. الأمثلة هي: المشي الميداني T.52 والتصويت على مخطط الجيب T.31 ورسم خرائط (المجتمع) T.7 واجتماعات المجتمع واجتماعات الفريق والملاحظة T.28 ومناقشات مجموعات التركيز T.14 وما بعد - مراقبة التوزيع. في بعض الظروف، قد يكون من الضروري البرمجة عن بعد E.10 وجمع البيانات.

يساعد استخدام طرق مختلفة في التقاط وجهات نظر مختلفة وفرز المعلومات إلى ثلاث فئات والتحقق منها، على سبيل المثال تتناول الملاحظة T.24 كيفية تخزين مياه الشرب على مستوى الأسرة كما يقوم التصويت على مخطط الجيب T.31 بمعالجة مصادر مياه الشرب. لا يجب أن تكون بيانات المراقبة مجرد أرقام (كعدد المراحيض التي تم بناؤها) ولكن حول ما إذا كان المجتمع راضيًا عنها وما إذا كانت المراحيض في حالة جيدة ويتم استخدامها. في العادة تكون البيانات الكمية والنوعية مطلوبة.
من المهم أيضًا مراقبة مشاركة المجتمع المحلي (الفصل  E ) - ضمان استشارة جميع قطاعات المجتمع، بما في ذلك الفئات الضعيفة وتمثيلها في جميع جوانب البرنامج. يجب تصنيف البيانات حسب العمر والجنس والإعاقة كحد أدنى.

تلعب مجموعة المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية دورًا رئيسيًا في تنسيق أنظمة المراقبة. توفر مجموعة أدوات تنسيق مجموعة المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية العالمية إرشادات حول كيفية إنشاء خطة رصد للاستجابة لمسائل المياه والصرف الصحي والنظافة الشخصية، مع المعلومات التي تم جمعها من مصادر مختلفة عبر القطاع.